巨鹿县人民检察院始建于1955年3月。“文化大革命(1966-1976年)”期间，即1968年3月巨鹿县成立了“公、检、法军事管制委员会”,原检察院被撤销。1978年7月再次组建巨鹿县人民检察院。2017年12月《关于巨鹿县深化国家监察体制改革涉及机构调整和人员转隶有关问题的通知》，撇销反贪污贿赂局、反渎职侵权局。

　　巨鹿县人民检察院恢复重建后办公地址历经三次变迁，检察长葛建民、谷保清、张迎春、赵新法吋期，在县城西大街北侧平房旧址办公;检察长牛保臣、谭景春时期，于1993年下半年搬迁至购买的原农业银行二层办公楼办公;我院现办公地址一技术侦查综合大楼投入使用始于检察长曹振义任内，位于县城黄巾大道北侧，自2006年8月投入使用。

　　目前，现内设机构为5个:第一检察部、第二检察部、第三检察部、办公室、政治部。现有政法专项编制35名。